二級域名是可以申請SSL證書的。SSL證書不僅可以用于頂級域名（一級域名），也可以用于二級域名。對于擁有多個二級域名的網站來說，可以考慮申請多域名SSL證書或者通配符SSL證書。

多域名SSL證書可以同時保護多個不同的域名，包括二級域名。這種證書適合于擁有多個獨立域名（包括二級域名）需要保護的情況。

通配符SSL證書則可以保護一個域名及其所有下一級子域名，無論子域名有多少個。例如，*.example.com 通配符證書可以保護 www.example.com、mail.example.com 等所有二級域名。

申請SSL證書時，需要通過證書頒發機構（CA）進行域名所有權的驗證。一旦驗證通過，CA會頒發SSL證書。對于二級域名的SSL證書申請，過程與頂級域名相似，但需要確保二級域名解析到了正確的服務器IP地址。

在配置SSL證書時，如果是在云服務平臺上，通常可以在云服務提供商的控制臺進行操作，如騰訊云、阿里云等。如果是自托管服務器，則需要在服務器上配置SSL證書，并確保Web服務器軟件（如Apache、Nginx）正確加載了證書文件。

需要注意的是，SSL證書的有效期通常為一年，需要定期更新。而且，從2020年9月起，新的SSL/TLS證書最長有效期變更為13個月，這意味著需要每年至少更新一次證書。

對于個人或小型項目，可以考慮使用免費的SSL證書，如Let's Encrypt提供的證書，但需要注意其有效期通常為90天，需要定期自動更新。對于商業用途，建議購買付費證書，以獲得更好的支持和服務。